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Investigación

Proteómica Funcional

Líneas de investigación

Contenidos con Investigacion Proteómica Funcional .

Caracterización molecular, identificación y validación de biomarcadores de cáncer colorrectal


El desarrollo del cáncer colorrectal se produce durante décadas como resultado de múltiples y acumulativas alteraciones genéticas que provocan la transformación de una lesión benigna en un adenoma y finalmente en un adenocarcinoma colorrectal (la secuencia adenoma-carcinoma). Este modelo propuesto por Bert Vogelstein en los años 80 que incluía alteraciones en APC, KRAS y p53 actualmente se considera demasiado escueto y múltiples estudios sugieren que la carcinogénesis es un proceso extremadamente complejo con múltiples alteraciones genéticas adicionales en un gran número de oncogenes y genes supresores de tumores. Estas mutaciones producidas en la célula tumoral provocan por un lado alteraciones a nivel de proteína (expresión, localización, mutación, quimeras, proteínas aberrantes, sobreactivación,…) y por otro lado una respuesta inmune humoral (autoanticuerpos) frente a proteínas alteradas en los pacientes -inmunómica- durante la formación y progresión tumoral, que una vez identificadas mediante proteómica pueden servir como biomarcadores de la patología.
Los objetivos de esta línea de investigación consisten en:

i) el análisis mediante proteómica del cáncer colorrectal con el fin de encontrar proteínas alteradas durante la formación y progresión de la enfermedad,

ii) análisis inmunómico y validación de autoantígenos específicos de la enfermedad, y

iii) desarrollo de inmunoensayos que permitan la detección múltiple de autoanticuerpos y proteínas alteradas para el diagnóstico temprano del cáncer colorrectal
Responsable de la línea: Rodrigo Barderas

 

Identificación de biomarcadores de deterioro cognitivo y Enfermedad de Alzheimer


La enfermedad de Alzheimer (EA) es la forma más común de demencia a nivel mundial. El desarrollo de la EA puede durar más de 20 años, pasando por las fases pre-clínica (surgen los primeros cambios histopatológicos, pero no se manifiestan síntomas clínicos), prodrómica (deterioro cognitivo leve, primeros síntomas clínicos leves) y clínica (enfermedad de Alzheimer). Las dos principales marcas histopatológicas de la EA incluyen la formación de placas amiloides extracelulares por la acumulación del péptido -amiloide, y la formación de ovillos neurofibrilares intraneuronales por la acumulación de la proteína TAU hiperfosforilada.

Además, durante la progresión de la enfermedad se producen también otros cambios histopatológicos, como son pérdida sináptica, disminución de neurotransmisores específicos, inflamación o muerte neuronal. Todos estos cambios están relacionados con alteraciones en las proteínas cerebrales, a nivel de expresión, localización, activación, mutaciones o frameshifts (expresión de proteínas aberrantes).

Además, las técnicas actuales para el diagnóstico de esta enfermedad son técnicas muy invasivas, poco específicas o que permiten un diagnóstico tardío de la enfermedad, cuando los tratamientos actualmente disponibles no van a ser eficaces para frenar la enfermedad.

Por todo ello, la caracterización del contenido proteico del cerebro de estos pacientes permitiría una mejor compresión de la patología, así como de los procesos biológicos que se ven alterados durante su progresión, lo cual posibilitaría la identificación de nuevas dianas terapéuticas y, potencialmente, el desarrollo de nuevos fármacos que permitan el tratamiento temprano y eficaz de la enfermedad. 
Los objetivos de esta línea de investigación consisten en:

i) analizar el contenido proteico del cerebro de pacientes de la EA e individuos sanos para identificar proteínas alteradas durante la progresión de la enfermedad mediante proteómica cuantitativa,

ii) identificar el papel funcional y patológico de dichas proteínas y su potencial implicación en el desarrollo de la enfermedad mediante el empleo de organoides y modelos murinos de la enfermedad,

iii) identificar proteínas desreguladas en individuos con deterioro cognitivo leve que puedan ser útiles para un diagnóstico temprano de la enfermedad mediante proteómica cuantitativa, empleando plasma y PBMCs (células mononucleares de sangre periférica) de dichos individuos y personas sanas,

iv)  identificación de biomarcadores plasmáticos con una alta capacidad diagnóstica de la enfermedad que permitan su diagnóstico temprano mediante análisis sanguíneo, y

v) desarrollo de inmunoensayos que permitan la detección múltiple de autoanticuerpos y proteínas alteradas para el diagnóstico temprano de la Enfermedad de Alzheimer. 
Responsables de la línea: Ana Montero Calle y Rodrigo Barderas Manchado

Otras líneas de Investigación (en colaboración):

Responsable: Rodrigo Barderas Manchado

  • Desarrollo de biosensores para la detección temprana de enfermedades crónicas con un foco especial en cáncer colorrectal y Enfermedad de Alzheimer (Dra. Susana Campuzano Ruiz, UCM).
  • Caracterización proteómica de enfermedades crónicas con un alto componente inflamatorio (Dra. Ana Guzmán Aránguez, UCM).
  • Obtención de anticuerpos y mimotopos mediante Phage Display para la detección de toxinas (Dra. Elena Benito Peña, UCM).
  • Desarrollo de micromotores para la detección de la EA (Dr. Alberto Escarpa, UAH).
  • Super-resolution analysis of protein markers: combining proteomics and super-resolution confocal microscopy (Dra. Susana Rocha, KU Leuven).
  • Proteomics analyses of chronic diseases (Dra. Marta L. Mendes, Luxembourg Institute of Health).

Responsable: Pablo San Segundo Acosta

 

  • Colaboración con la Doctora Bonnie J. Murphy, directora del laboratorio de enzimas redox y metaloproteínas del Instituto Max Planck de Biofísica, para el estudio estructural y bioquímico de NADPH oxidasas bacterianas mediante criomicroscopía electrónica y otras técnicas afines.
  • Colaboración con la Doctora Bonnie J. Murphy y el profesor Seigo Shima (Max Planck Institute of Terrestrial Microbiology), para el estudio de supercomplejos metanogénicos mediante criomicroscopía. 
     

Proyectos de investigación

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Proyectos en curso

  • PROYECTO: Desfragmentación del papel principal en cáncer colorrectal como biomarcadores y para intervención terapéutica de proteínas de unión a RNA, proteínas oscuras y PTMs. Entidad Financiadora: AES-ISCIII. Investigador Principal: Rodrigo Barderas Manchado. Duración: 2024-2026. Cuantía: 152.000 €. PI23CIII/00027
  • PROYECTO: Enfermedades crónicas y proteoma fantasma: identificación y validación de proteínas alternativas como marcadores específicos (GhostProtCD). Entidad Financiadora: MINECO. Investigador Principal: Rodrigo Barderas Manchado. Duración: 2023-2027. Cuantía: 200.000 €. PID2022-140307OB-I00
  • PROYECTO: ALADDIN - Accelerated Discovery Nanobody Platform. Entidad Financiadora: European Union: HORIZON-EIC2023-PATHFINDEROPEN-01-01. Investigadores Principales: Luis Ángel Fernández (CNB-CSIC), Rodrigo Barderas Manchado (ISCIII), Dina Schneidman (HUJI), Alar Inla & Lorena Dieguez (INL), Lasse Jensen (LIU), Carmen Palomino (Zirka InnoTech), Georgios Lolas (InCELLIA), Javier Martínez Useros (IIS-FJD). Duración: 2024-2027. Cuantía: 3.316.191 €. 101130574
  • PROYECTO: Medicina Personalizada (MedPer) en la detección precoz del deterioro cognitivo (DC) preclinico. Desarrollo de un modelo predictivo de riesgo. Entidad Financiadora: Proyectos de Investigación de Medicina Personalizada de Precisión de la Acción Estratégica en Salud 2021-2023. Investigadores Principales: Ángeles Almeida Parra, Mayte Moreno Casbas y Rodrigo Barderas Manchado. Duración: 2022-2024. Cuantía: 1.793.750 €. PMP22/00084 
  • PROYECTO: Desarrollo preclínico y evolución de anticuerpos de segunda generación para el tratamiento del cáncer colorrectal metastásico. Entidad Financiadora: Proyectos de I+D+I vinculados a la medicina personalizada y terapias avanzadas. Investigadores Principales: Jose Ignacio Casal Álvarez, Juan Ignacio Imbaud, Joaquín Arribas y Rodrigo Barderas Manchado. Duración: 2023-2024. Cuantía: 629.877,22 €. PMPTA22/00108
  • PROYECTO: Identificación y validación de biomarcadores de cáncer colorrectal involucrados en la diseminación del tumor. Entidad Financiadora: AES-ISCIII. Investigador Principal: Rodrigo Barderas. Duración: 2021-2024.  Cuantía: 112.000 €. PI20CIII/00019.

Proyectos anteriores

  • PROYECTO: Análisis inmunómico y proteómico cuantitativo dl cáncer colorrectal y enfermedades crónicas negativamente relacionadas para su diagnóstico temprano. Entidad Financiadora: AES-ISCIII. Investigador Principal: Rodrigo Barderas. Duración: 2018-2021. Cuantía: 89000 € + Técnico FPII. PI17CIII/00045.
  • PROYECTO: Disfunción de la barrera epitelial y marcadores específicos: hacia conceptos y metodologías emergentes. Entidad Financiadora: MINECO. Investigador Principal: Rodrigo Barderas y Mayte Villalba. Duración: 2015-2017. Cuantía: 140.000 € + costes indirectos. SAF2014-53209-R.
  • PROYECTO: Plataforma en Red de Recursos Biomoleculares y Bioinformáticos (Proteored ISCIII). Entidad Financiadora: ISCIII. Investigador Asociado al Nodo del CIB: Investigador Principal: Ignacio Casal. 2014-2017
  • PROYECTO: ASMA, REACCIONES ADVERSAS Y ALÉRGICAS. Redes Temáticas de Investigación Cooperativa en Salud (ARADyAL). Entidad Financiadora: Ministerio de Economía y competitividad. ISCIII RD16/0006/0014. Investigador Principal: María José Torres. Duración: 2017-2020. Investigador en Grupo UCM.
     
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Liste I Amyloid Precursor Protein (APP) Regulates Gliogenesis and Neurogenesis of Human Neural Stem Cells by Several Signaling Pathways

Coronel R, Bernabeu-Zornoza A, Palmer C, González R, Mateos P, Rosca A., Lopez-Alonso V, Liste I Amyloid Precursor Protein (APP) Regulates Gliogenesis and Neurogenesis of Human Neural Stem Cells by Several Signaling Pathways, Int J Mol Sci. 2023: 24(16):12964. Q1.

In-depth proteomics characterization of ∆Np73 effectors identifies key proteins with diagnostic potential implicated in lymphangiogenesis, vasculogenesis and metastasis in colorectal cancer

Garranzo-Asensio M, Rodríguez-Cobos J, San Millán C, Poves C, Fernández-Aceñero MJ, Pastor-Morate D, Viñal D, Montero-Calle A, Solís-Fernández G, Ceron MA, Gámez-Chiachio M, Rodríguez N, Guzmán-Aránguez A, Barderas R, Domínguez G. In-depth proteomics characterization of ∆Np73 effectors identifies key proteins with diagnostic potential implicated in lymphangiogenesis, vasculogenesis and metastasis in colorectal cancer. Molecular Oncology 2022; 16: 2672.

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Screening Assays to Characterize Novel Endothelial Regulators Involved in the Inflammatory Response

MA Higueras; L Jiménez-García; S Herranz; S Hortelano; A Luque. 2017. Screening Assays to Characterize Novel Endothelial Regulators Involved in the Inflammatory Response. J Vis Exp. 2017 Sep 15;(127). https://doi.org/10.3791/55824.

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The C-terminus of H-Ras as a target for the covalent binding of reactive compounds modulating Rasdependent pathways

Oeste CL, Díez-Dacal B, Bray F, García de Lacoba M, de la Torre BG, Andreu D, Ruiz-Sánchez AJ, Pérez-Inestrosa E, García-Domínguez CA, Rojas, JM & Pérez-Sala D. The C-terminus of H-Ras as a target for the covalent binding of reactive compounds modulating Rasdependent pathways. PloS ONE. 2011; 6(1): e15866. doi:10.1371/journal.pone.0015866

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Physiological and pathological effects of amyloid-β species in neural stem cell biology

Physiological and pathological effects of amyloid-β species in neural stem cell biology. Bernabeu-Zornoza A, Coronel R, Palmer C, Monteagudo M, Zambrano A, Liste I. Neural Regen Res. 2019 Dec;14(12):2035-2042. doi: 10.4103/1673-5374.262571. PMID: 31397330; PMCID: PMC6788229.

PUBMED DOI

Lactoferrin as Immune-Enhancement Strategy for SARS-CoV-2 Infection in Alzheimer's Disease Patients

Bartolomé F, Rosa L, Valenti P, Lopera F, Hernández-Gallego J, Cantero JL, Orive G, Carro E. Lactoferrin as Immune-Enhancement Strategy for SARS-CoV-2 Infection in Alzheimer's Disease Patients. Front Immunol. 2022 Apr 25;13:878201. doi: 10.3389/fimmu.2022.878201

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Netrin-1 in Glioblastoma Neovascularization: The New Partner in Crime?

Vásquez X, Sánchez-Gómez P*, Palma V*. (* Co-corresponding author) (2021) Netrin-1 in Glioblastoma Neovascularization: The New Partner in Crime? Int J Mol Sci. 2021 Jul 31;22(15):8248. PMID: 34361013 doi: 10.3390/ijms22158248.

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Mitochondrial haplogroups are associated with clinical pattern of AIDS progression in HIV-infected patients. Journal of acquired immune deficiency syndromes• Mitochondrial haplogroups are associated with clinical pattern of AIDS progression in HIV-infected patients. Journal of acquired immune deficiency syndromes

Mitochondrial haplogroups are associated with clinical pattern of AIDS progression in HIV-infected patients. Journal of acquired immune deficiency syndromes. María Guzmán Fulgencio; José Luis Jiménez; Mónica García Álvarez; José María Bellón; Amanda Fernández Rodriguez; Yolanda Campos; Carmen Rodríguez; Juan González Garcia; Melchor Riera; Pompeyo Viciana; Ma Ángeles Muñoz Fernández; Salvador Resino. J Acquir Immune Defic Syndr. 2013 ;63:178-83. DOI: 10.1097/QAI.0b013e3182893f74

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Combined use of pharmacophoric models together with drug metabolism and genotoxicity "in silico" studies in the hit finding process

Jerez MJ, Jerez M, González-García C, Ballester S and Castro A. Combined use of pharmacophoric models together with drug metabolism and genotoxicity "in silico" studies in the hit finding process. Journal of Computer-Aided Molecular Design (2013) 27-1, pp.79-90. ISSN 1573-4951 doi:10.1007/s10822-012-9627-1

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Basolateral sorting of the sodium iodide symporter (NIS) is mediated by AP-1 clathrin adaptor complexes

Koumarianou P, Fernández-Méndez C, Mielu LM, Fajardo-Delgado D, Santisteban P* and De la Vieja A*. Basolateral sorting of the sodium iodide symporter (NIS) is mediated by AP-1 clathrin adaptor complexes. Thyroid 2022. doi: 10.1089/thy.2022.0163. PMID: 35833460. NOTA: Artículo seleccionado para portada de la revista.

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Intensity distribution segmentation in ultrafast Doppler combined with scanning laser confocal microscopy for assessing vascular changes associated with ageing in murine hippocampi

Anzibar Fialho M, Vázquez Alberdi L, Martínez M, Calero M, Baranger J, Tanter M, Damián JP, Negreira C, Rubido N, Kun A, Brum J. Intensity distribution segmentation in ultrafast Doppler combined with scanning laser confocal microscopy for assessing vascular changes associated with ageing in murine hippocampi. Sci Rep. 2022 12(1):6784. doi: 10.1038/s41598-022-10457-9. Erratum in: Sci Rep. 2022 10;12(1):7626.

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Age-dependent nasal immune responses in non-hospitalized bronchiolitis children

Cortegano I, Rodriguez M, Hernan-Gomez S, Arrabal A, Garcia-Vao C, Rodriguez J, et al. Age-dependent nasal immune responses in non-hospitalized bronchiolitis children. Front Immunol. 2022;13:1011607. Q1.

Structural and mechanistic insights into Streptococcus pneumoniae NADPH oxidase

Dubach VRA, San Segundo-Acosta P, Murphy BJ. Structural and mechanistic insights into Streptococcus pneumoniae NADPH oxidase. Nature Structural & Molecular Biology. 2024

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,9-dehydrohispanolone-15,16-lactol diterpene prevents LPS-triggered inflammatory response by inhibiting endothelial activation

L Jiménez-García; PG Través; R López-Fontal; S Herranz; MA Higueras; B de las Heras; S Hortelano; A Luque. 2016. 8,9-dehydrohispanolone-15,16-lactol diterpene prevents LPS-triggered inflammatory response by inhibiting endothelial activation. Biochem J. 2016 Jul 15;473(14):2061-71. https://doi.org/10.1042/BCJ20160343.

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Sprouty2 and Spred1-2 proteins inhibit the activation of the ERK pathway elicited by cyclopentenone prostanoids

García-Domínguez CA, Martínez N, Gragera T, Pérez-Rodríguez A, Retana D, León G, Sánchez A, Oliva JL, Pérez-Sala D & Rojas JM. Sprouty2 and Spred1-2 proteins inhibit the activation of the ERK pathway elicited by cyclopentenone prostanoids. PloS ONE. 2011; 6(2): e16787. doi:10.1371/journal.pone.0016787

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Effects of chlorpyrifos on cell death and cellular phenotypic specification of human neural stem cells

Effects of chlorpyrifos on cell death and cellular phenotypic specification of human neural stem cells. Sandoval L, Rosca A, Oniga A, Zambrano A, Ramos JJ, González MC, Liste I, Motas M. Sci Total Environ. 2019 Sep 15;683:445-454. doi: 10.1016/j.scitotenv.2019.05.270. Epub 2019 May 20. PMID: 31136966

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Low levels of amyloid precursor protein (APP) promote neurogenesis and decrease gliogenesis in human neural stem cells

Coronel, R.; López-Alonso, V.; Gallego, M.I.; Liste, I. (2023). Low levels of amyloid precursor protein (APP) promote neurogenesis and decrease gliogenesis in human neural stem cells. Int J Mol Sci. 24, 14635. doi: 10.3390/ijms241914635.

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Disturbed circadian rhythm and retinal degeneration in a mouse model of Alzheimer's disease

Carrero L, Antequera D, Alcalde I, Megías D, Figueiro-Silva J, Merayo-Lloves J, Municio C, Carro E. Disturbed circadian rhythm and retinal degeneration in a mouse model of Alzheimer's disease. Acta Neuropathol Commun. 2023 Mar 31;11(1):55. doi: 10.1186/s40478-023-01529-6.

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Tumor-derived pericytes driven by EGFR mutations govern the vascular and immune microenvironment of gliomas

Segura-Collar B, Garranzo-Asensio M, Herranz B, Hernández-SanMiguel E, Cejalvo T, Casas BS, Matheu A, Pérez-Núñez Á, Sepúlveda-Sánchez JM, Hernández-Laín A, Palma V, Gargini R, Sánchez-Gómez P. (2021) Tumor-derived pericytes driven by EGFR mutations govern the vascular and immune microenvironment of gliomas. Cancer Res. 81(8):2142-2156. PMID: 33593822 doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-3558

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Clinical and cellular consequences of the mutation m.12300G>A in the mitochondrial tRNA(Leu(CUN)

Clinical and cellular consequences of the mutation m.12300G>A in the mitochondrial tRNA(Leu(CUN). Martín Jiménez, R.; Martín Hernández, E.; Cabello, A.;García Silva, MT.; Arenas, J.; Campos, Y. 2012. Mitochondrion. 12: 288-293. DOI: 10.1016/j.mito.2011.10.004

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Intraepithelial paracrine Hedgehog signaling induces the expansion of ciliated cells that express diverse progenitor cell markers in the basal epithelium of the mouse mammary gland

García-Zaragoza, E.; Pérez-Tavarez, R.; Ballester, A.; Lafarga, V.; Jiménez- Reinoso, A.; Jiménez-Reinoso, A.; Ramírez, A.; Murillas, R. and Gallego, M.I. Intraepithelial paracrine Hedgehog signaling induces the expansion of ciliated cells that express diverse progenitor cell markers in the basal epithelium of the mouse mammary gland. Dev. Biol. (2012) 372-1, pp.28-44. PMID: 23000969 doi:10.1016/j.ydbio.2012.09.005

PUBMED DOI

Mesenchymal Stem Cells delivery in individuals with different pathologies. Multimodal tracking, safety and future applications

Belmar-López C, Vassaux G, Medel-Martinez A, Burnet J, Quintanilla M, Ramón Y Cajal S, Hernandez-Losa J, De la Vieja A*, and Martin-Duque P*. Mesenchymal Stem Cells delivery in individuals with different pathologies. Multimodal tracking, safety and future applications. International Journal of Molecular Sciences 2022 Jan 31;23(3):1682. doi: 10.3390/ijms23031682. PMID: 35163605

PUBMED DOI

Curcumin and Ethanol Effects in Trembler-J Schwann Cell Culture

Vázquez Alberdi L, Rosso G, Velóz L, Romeo C, Farias J, Di Tomaso MV, Calero M, Kun A. Curcumin and Ethanol Effects in Trembler-J Schwann Cell Culture. Biomolecules. 2022 12(4):515. doi: 10.3390/biom12040515.

DOI

Telomere length analysis in amyotrophic lateral sclerosis using large-scale whole genome sequence data

Al Khleifat A, Iacoangeli A, Jones AR, van Vugt J, Moisse M, Shatunov A, et al. Telomere length analysis in amyotrophic lateral sclerosis using large-scale whole genome sequence data. Front Cell Neurosci. 2022;16:1050596. Q1.

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Al Khleifat A, Iacoangeli A, Jones AR, van Vugt J, Moisse M, Shatunov A, et al. Telomere length analysis in amyotrophic lateral sclerosis using large-scale whole genome sequence data. Front Cell Neurosci. 2022;16:1050596. Q1.

An HPF1/PARP1-Based Chemical Biology Strategy for Exploring ADP-Ribosylation

Bonfiglio JJ, Leidecker O, Dauben H, Longarini EJ, Colby T, San Segundo-Acosta P, Perez KA, Matic I. An HPF1/PARP1-Based Chemical Biology Strategy for Exploring ADP-Ribosylation. Cell. 2020; 183:1086-1102.e23.

DOI

Regulation of endothelial dynamics by PGC-1alpha relies on ROS control of VEGF-A signaling Free Radic Biol Med

I Prieto; C Sánchez-Ramos; A Luque; E Arza; Y Olmos; M Monsalve. (3/6). 2016. Regulation of endothelial dynamics by PGC-1alpha relies on ROS control of VEGF-A signaling Free Radic Biol Med. 2016 Apr;93:41-51. https://doi.org/10.1016/j.freeradbiomed.2016.01.021

DOI

Sos GEFs: old concepts and new perspectives

Rojas JM, Oliva JL & Santos E. Mammalian Sos GEFs: old concepts and new perspectives. Genes & Cancer. 2011; 2: 298-305. doi: 10.1177/1947601911408078

DOI

Early induction of senescence and immortalization in PGC-1α-deficient mouse embryonic fibroblasts

Early induction of senescence and immortalization in PGC-1α-deficient mouse embryonic fibroblasts. Prieto I, Zambrano A, Laso J, Aranda A, Samper E, Monsalve M. Free Radic Biol Med. 2019 Jul;138:23-32. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2019.04.015. Epub 2019 Apr 25. PMID: 31029787.

PUBMED DOI

Amyloid precursor protein (APP) regulates gliogenesis and neurogenesis of human neural stem cells by several signaling pathways

Coronel, R.; Bernabeu-Zornoza, A.; Palmer, C.; González-Sastre, R.; Rosca, A.; Mateos-Martínez, P.; López-Alonso, V.; Liste, I. (2023). Amyloid precursor protein (APP) regulates gliogenesis and neurogenesis of human neural stem cells by several signaling pathways. Int J Mol Sci. 24, 12964. doi: 10.3390/ijms241612964.

DOI

Altered Clock Gene Expression in Female APP/PS1 Mice and Aquaporin-Dependent Amyloid Accumulation in the Retina

Carrero L, Antequera D, Alcalde I, Megias D, Ordoñez-Gutierrez L, Gutierrez C, Merayo-Lloves J, Wandosell F, Municio C, Carro E. Altered Clock Gene Expression in Female APP/PS1 Mice and Aquaporin-Dependent Amyloid Accumulation in the Retina. Int J Mol Sci. 2023 Oct 27;24(21):15679. doi: 10.3390/ijms242115679.

DOI

Blood-Brain Barrier Disruption: A Common Driver of Central Nervous System Diseases

Segura-Collar B, Mata-Martínez P, Hernández-Laín A, Sánchez-Gómez P*, Gargini R*. (* co-corresponding) (2021) Blood-Brain Barrier Disruption: A Common Driver of Central Nervous System Diseases. The Neuroscientist. Jan 15: 1073858420985838. PMID: 33446074 doi: 10.1177/1073858420985838

DOI

Proteomics analysis of prefrontal cortex of Alzheimer’s disease patients revealed dysregulated proteins in the disease and novel proteins associated with amyloid-β pathology

Montero-Calle, A.; Coronel, R.; Garranzo-Asensio, M.; Solís-Fernández, G.; Rábano, A.; de los Ríos, V.; Fernández-Aceñero, M.J.; Mendes, M.L.; Martínez-Useros, J.; Megías, D.; Moreno-Casbas, M.T.; Peláez-García, A.; Liste, I.; Barderas, R. (2023). Proteomics analysis of prefrontal cortex of Alzheimer’s disease patients revealed dysregulated proteins in the disease and novel proteins associated with amyloid-β pathology. Cell Mol Life Sci. 80, 141. doi: 10.1007/s00018-023-04791-y

DOI

Human immunodeficiency virus type 1 chronic infection is associated with different gene expression in MT-4, H9 and U937 cell lines

Olivares I, Ballester A, Lombardia L, Domínguez O and López-Galíndez C. Human immunodeficiency virus type 1 chronic infection is associated with different gene expression in MT-4, H9 and U937 cell lines. Virus research (2009) 139-1, pp.22-31. ISSN0168-1702 doi:10.1016/j.virusres.2008.09.010

PUBMED DOI

The complex regulation of NIS expression and activity in thyroid and extrathyroidal tissues

Riesco-Eizaguirre G*, Santisteban P and De la Vieja A*. The complex regulation of NIS expression and activity in thyroid and extrathyroidal tissues. Endocrine-Related Cancer 2021 28(10):T141-T165. PMID: 34387194. doi: 10.1530/ERC-21-0217

DOI

New insights into the genetic etiology of Alzheimer's disease and related dementias

Bellenguez et al. New insights into the genetic etiology of Alzheimer's disease and related dementias. Nat Genet. 2022 54(4):412-436. doi: 10.1038/s41588-022-01024-z.

DOI

Metabolic Reprogramming Helps to Define Different Metastatic Tropisms in Colorectal Cancer

Montero-Calle A, Gomez de Cedron M, Quijada-Freire A, Solis-Fernandez G, Lopez-Alonso V, Espinosa-Salinas I, et al. Metabolic Reprogramming Helps to Define Different Metastatic Tropisms in Colorectal Cancer. Front Oncol. 2022;12:903033. Q1

Multiplexed monitoring of a novel autoantibody diagnostic signature of colorectal cancer using HaloTag technology-based electrochemical immunosensing platform

Garranzo-Asensio M, Guzmán-Aránguez A, Povedano E, Ruiz-Valdepeñas Montiel V, Poves C, Fernandez-Aceñero MJ, Montero-Calle A, Solís-Fernández G, Fernandez-Diez S, Camps J, Arenas M, Rodríguez-Tomàs E, Joven J, Sanchez-Martinez M, Rodriguez N, Dominguez G, Yáñez-Sedeño P, Pingarrón JM, Campuzano S, Barderas R. Multiplexed monitoring of a novel autoantibody diagnostic signature of colorectal cancer using HaloTag technology-based electrochemical immunosensing platform. Theranostics 2020; 10(7):3022-3034.

DOI

Intersectin 1 enhances Cbl ubiquitylation of epidermal growth factor receptor through regulation of Sprouty2-Cbl interaction

Okur MN, Zhu JO, Fong CW, Martinez N, Garcia-Dominguez C, Rojas JM, Guy G & O'Bryan J. Intersectin 1 enhances Cbl ubiquitylation of epidermal growth factor receptor through regulation of Sprouty2-Cbl interaction. Molecular and Cellular Biology. 2012; 32(4):817-25. doi:10.1128/MCB.05647-11

DOI

Tumor suppressor ARF regulates tissue microenvironment and tumorgrowth through modulation of macrophage polarization Oncotarget

L Jiménez-García; S Herranz; MA Higueras; (AC); A Luque; S Hortelano. 2016. Tumor suppressor ARF regulates tissue microenvironment and tumorgrowth through modulation of macrophage polarization Oncotarget. 2016 Oct 11;7(41):66835-66850. https://doi.org/10.18632/oncotarget.11652.

DOI

Contenidos con Investigacion Proteómica Funcional .

Listado de personal

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El objetivo principal de la Unidad de PROTEÓMICA FUNCIONAL consiste en la identificación de biomarcadores de las enfermedades crónicas más prevalentes utilizando herramientas proteómicas de última generación. Para ello utilizamos técnicas basadas en espectrometría de masas y microarrays de anticuerpos para identificar proteínas alteradas durante la formación y progresión de dichas enfermedades, así como microarrays de proteínas y fagos para analizar la respuesta humoral que tiene lugar en dichos pacientes e identificar autoanticuerpos como biomarcadores específicos de dichas enfermedades. Asimismo, buscamos desarrollar e implementar nuevos métodos que permitan el diagnóstico temprano de dichas patologías.  Nuestro foco de estudio es el cáncer de colon y enfermedades crónicas relacionadas negativamente. Una vez identificadas las moléculas alteradas buscamos entender mediante ensayos funcionales cómo dichas alteraciones afectan a nivel molecular durante la formación y progresión de dichas patologías con el fin de identificar nuevas dianas terapéuticas que permitan actuar contra ellas.  Las principales contribuciones científicas del Grupo de investigación están enmarcadas en el campo de la Proteómica, Cáncer e Inmunología, contribuyendo en los últimos años a la identificación de proteínas y autoanticuerpos específicos de cáncer colorrectal, y al desarrollo de inmunoensayos que permitan un diagnóstico temprano de la patología.


 

 

Noticias/Actualidad/divulgación
Se puede seguir la actualidad y noticias vinculadas a la Unidad de Proteómica Funcional en la cuenta de X

(Barderas' Lab (@ProteoFun) / X, antiguo Twitter)

 
Premios

Distintos miembros del grupo como investigadores predoctorales, postdoctorales o como IP o en colaboración con el grupo de Electroanalisis y Biosensores Electroquímicos liderado por la Dra. Susana Campuzano Ruiz de la Universidad Complutense de Madrid (@GEBE en X) han obtenido 20 premios a comunicaciones tipo póster o comunicaciones orales.
Entre ellos se quiere destacar:

  1. Premios tipo póster: Premios a la comunicación tipo póster de la EAACI 2015, de la Human Proteome Organization 2014, de la SEPROT 2019, 2022, entre otros.
  2. Entre los premios a comunicaciones orales destacar el Premio IMMUNOTEK a la mejor exposición oral de las jornadas de la Sociedad de Inmunología de la Comunidad de Madrid 2015 (Pablo San Segundo Acosta), Joint Congress de las Sociedades Española, Francesa y Portuguesa de Proteómica 2022 en Vilamoura (2022).
  3. “III Premio de Investigación en Medicina Personalizada de Precisión” de la Fundación Roche y la UCM en Febrero de 2022. Rodrigo Barderas, Susana Campuzano y José Manuel Pingarrón.

Patentes

  • Nuevo método para el diagnósitco de glaucoma o cataratas en un sujeto.

Autores: Ana Montero Calle, Raquel Rejas González, Ana Guzmán Aránguez, Alejandro Valverde, Susana Campuzano y Rodrigo Barderas.

Número de solicitud: P202430051. Fecha de recepción: 22 enero 2024.  

  • Método de Diagnóstico/Pronóstico del cáncer colorrectal basado en la detección en suero de anticuerpos frente a autoantígenos tumorales. 

Autores: Ingrid Babel, José Ignacio Casal Álvarez, Rodrigo Barderas.

Número de solicitud: P201030708. Fecha: 13 de mayo de 2010.

Licenciada a Protein Alternatives, S.L. 

  • Método de obtención de datos útiles para el diagnóstico o el pronóstico del cáncer colorrectal. 

Autores: Ingrid Babel, José Ignacio Casal Álvarez, Rodrigo Barderas.

Número de solicitud: P200930203. Fecha: 29 de mayo de 2009.

Licenciada a Protein Alternatives, S.L. 

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