El Instituto de Salud Carlos III utiliza cookies propias y de terceros para el correcto funcionamiento y visualización del sitio web por parte del usuario, así como la recogida de estadísticas. Si continúa navegando, consideramos que acepta su uso. Para más información visite nuestra Política de Cookies. Texto política de cookies
Ver más información
Logo del Gobierno de España Logo del Ministerio de ciencia, innovación y universidades Logo del Instituto de Salud Carlos tercero Logo UFIEC

Protegemos tu salud a través de la Ciencia

Barra de búsqueda

Usa comillas para buscar una secuencia de palabras exacta. Ej: "Proyectos Financiados"

Investigación

Proteómica Funcional

Líneas de investigación

Contenidos con Investigacion Proteómica Funcional .

Caracterización molecular, identificación y validación de biomarcadores de cáncer colorrectal


El desarrollo del cáncer colorrectal se produce durante décadas como resultado de múltiples y acumulativas alteraciones genéticas que provocan la transformación de una lesión benigna en un adenoma y finalmente en un adenocarcinoma colorrectal (la secuencia adenoma-carcinoma). Este modelo propuesto por Bert Vogelstein en los años 80 que incluía alteraciones en APC, KRAS y p53 actualmente se considera demasiado escueto y múltiples estudios sugieren que la carcinogénesis es un proceso extremadamente complejo con múltiples alteraciones genéticas adicionales en un gran número de oncogenes y genes supresores de tumores. Estas mutaciones producidas en la célula tumoral provocan por un lado alteraciones a nivel de proteína (expresión, localización, mutación, quimeras, proteínas aberrantes, sobreactivación,…) y por otro lado una respuesta inmune humoral (autoanticuerpos) frente a proteínas alteradas en los pacientes -inmunómica- durante la formación y progresión tumoral, que una vez identificadas mediante proteómica pueden servir como biomarcadores de la patología.
Los objetivos de esta línea de investigación consisten en:

i) el análisis mediante proteómica del cáncer colorrectal con el fin de encontrar proteínas alteradas durante la formación y progresión de la enfermedad,

ii) análisis inmunómico y validación de autoantígenos específicos de la enfermedad, y

iii) desarrollo de inmunoensayos que permitan la detección múltiple de autoanticuerpos y proteínas alteradas para el diagnóstico temprano del cáncer colorrectal
Responsable de la línea: Rodrigo Barderas

 

Identificación de biomarcadores de deterioro cognitivo y Enfermedad de Alzheimer


La enfermedad de Alzheimer (EA) es la forma más común de demencia a nivel mundial. El desarrollo de la EA puede durar más de 20 años, pasando por las fases pre-clínica (surgen los primeros cambios histopatológicos, pero no se manifiestan síntomas clínicos), prodrómica (deterioro cognitivo leve, primeros síntomas clínicos leves) y clínica (enfermedad de Alzheimer). Las dos principales marcas histopatológicas de la EA incluyen la formación de placas amiloides extracelulares por la acumulación del péptido -amiloide, y la formación de ovillos neurofibrilares intraneuronales por la acumulación de la proteína TAU hiperfosforilada.

Además, durante la progresión de la enfermedad se producen también otros cambios histopatológicos, como son pérdida sináptica, disminución de neurotransmisores específicos, inflamación o muerte neuronal. Todos estos cambios están relacionados con alteraciones en las proteínas cerebrales, a nivel de expresión, localización, activación, mutaciones o frameshifts (expresión de proteínas aberrantes).

Además, las técnicas actuales para el diagnóstico de esta enfermedad son técnicas muy invasivas, poco específicas o que permiten un diagnóstico tardío de la enfermedad, cuando los tratamientos actualmente disponibles no van a ser eficaces para frenar la enfermedad.

Por todo ello, la caracterización del contenido proteico del cerebro de estos pacientes permitiría una mejor compresión de la patología, así como de los procesos biológicos que se ven alterados durante su progresión, lo cual posibilitaría la identificación de nuevas dianas terapéuticas y, potencialmente, el desarrollo de nuevos fármacos que permitan el tratamiento temprano y eficaz de la enfermedad. 
Los objetivos de esta línea de investigación consisten en:

i) analizar el contenido proteico del cerebro de pacientes de la EA e individuos sanos para identificar proteínas alteradas durante la progresión de la enfermedad mediante proteómica cuantitativa,

ii) identificar el papel funcional y patológico de dichas proteínas y su potencial implicación en el desarrollo de la enfermedad mediante el empleo de organoides y modelos murinos de la enfermedad,

iii) identificar proteínas desreguladas en individuos con deterioro cognitivo leve que puedan ser útiles para un diagnóstico temprano de la enfermedad mediante proteómica cuantitativa, empleando plasma y PBMCs (células mononucleares de sangre periférica) de dichos individuos y personas sanas,

iv)  identificación de biomarcadores plasmáticos con una alta capacidad diagnóstica de la enfermedad que permitan su diagnóstico temprano mediante análisis sanguíneo, y

v) desarrollo de inmunoensayos que permitan la detección múltiple de autoanticuerpos y proteínas alteradas para el diagnóstico temprano de la Enfermedad de Alzheimer. 
Responsables de la línea: Ana Montero Calle y Rodrigo Barderas Manchado

Otras líneas de Investigación (en colaboración):

Responsable: Rodrigo Barderas Manchado

  • Desarrollo de biosensores para la detección temprana de enfermedades crónicas con un foco especial en cáncer colorrectal y Enfermedad de Alzheimer (Dra. Susana Campuzano Ruiz, UCM).
  • Caracterización proteómica de enfermedades crónicas con un alto componente inflamatorio (Dra. Ana Guzmán Aránguez, UCM).
  • Obtención de anticuerpos y mimotopos mediante Phage Display para la detección de toxinas (Dra. Elena Benito Peña, UCM).
  • Desarrollo de micromotores para la detección de la EA (Dr. Alberto Escarpa, UAH).
  • Super-resolution analysis of protein markers: combining proteomics and super-resolution confocal microscopy (Dra. Susana Rocha, KU Leuven).
  • Proteomics analyses of chronic diseases (Dra. Marta L. Mendes, Luxembourg Institute of Health).

Responsable: Pablo San Segundo Acosta

 

  • Colaboración con la Doctora Bonnie J. Murphy, directora del laboratorio de enzimas redox y metaloproteínas del Instituto Max Planck de Biofísica, para el estudio estructural y bioquímico de NADPH oxidasas bacterianas mediante criomicroscopía electrónica y otras técnicas afines.
  • Colaboración con la Doctora Bonnie J. Murphy y el profesor Seigo Shima (Max Planck Institute of Terrestrial Microbiology), para el estudio de supercomplejos metanogénicos mediante criomicroscopía. 
     

Proyectos de investigación

Contenidos con Investigacion Proteómica Funcional .

Proyectos en curso

  • PROYECTO: Desfragmentación del papel principal en cáncer colorrectal como biomarcadores y para intervención terapéutica de proteínas de unión a RNA, proteínas oscuras y PTMs. Entidad Financiadora: AES-ISCIII. Investigador Principal: Rodrigo Barderas Manchado. Duración: 2024-2026. Cuantía: 152.000 €. PI23CIII/00027
  • PROYECTO: Enfermedades crónicas y proteoma fantasma: identificación y validación de proteínas alternativas como marcadores específicos (GhostProtCD). Entidad Financiadora: MINECO. Investigador Principal: Rodrigo Barderas Manchado. Duración: 2023-2027. Cuantía: 200.000 €. PID2022-140307OB-I00
  • PROYECTO: ALADDIN - Accelerated Discovery Nanobody Platform. Entidad Financiadora: European Union: HORIZON-EIC2023-PATHFINDEROPEN-01-01. Investigadores Principales: Luis Ángel Fernández (CNB-CSIC), Rodrigo Barderas Manchado (ISCIII), Dina Schneidman (HUJI), Alar Inla & Lorena Dieguez (INL), Lasse Jensen (LIU), Carmen Palomino (Zirka InnoTech), Georgios Lolas (InCELLIA), Javier Martínez Useros (IIS-FJD). Duración: 2024-2027. Cuantía: 3.316.191 €. 101130574
  • PROYECTO: Medicina Personalizada (MedPer) en la detección precoz del deterioro cognitivo (DC) preclinico. Desarrollo de un modelo predictivo de riesgo. Entidad Financiadora: Proyectos de Investigación de Medicina Personalizada de Precisión de la Acción Estratégica en Salud 2021-2023. Investigadores Principales: Ángeles Almeida Parra, Mayte Moreno Casbas y Rodrigo Barderas Manchado. Duración: 2022-2024. Cuantía: 1.793.750 €. PMP22/00084 
  • PROYECTO: Desarrollo preclínico y evolución de anticuerpos de segunda generación para el tratamiento del cáncer colorrectal metastásico. Entidad Financiadora: Proyectos de I+D+I vinculados a la medicina personalizada y terapias avanzadas. Investigadores Principales: Jose Ignacio Casal Álvarez, Juan Ignacio Imbaud, Joaquín Arribas y Rodrigo Barderas Manchado. Duración: 2023-2024. Cuantía: 629.877,22 €. PMPTA22/00108
  • PROYECTO: Identificación y validación de biomarcadores de cáncer colorrectal involucrados en la diseminación del tumor. Entidad Financiadora: AES-ISCIII. Investigador Principal: Rodrigo Barderas. Duración: 2021-2024.  Cuantía: 112.000 €. PI20CIII/00019.

Proyectos anteriores

  • PROYECTO: Análisis inmunómico y proteómico cuantitativo dl cáncer colorrectal y enfermedades crónicas negativamente relacionadas para su diagnóstico temprano. Entidad Financiadora: AES-ISCIII. Investigador Principal: Rodrigo Barderas. Duración: 2018-2021. Cuantía: 89000 € + Técnico FPII. PI17CIII/00045.
  • PROYECTO: Disfunción de la barrera epitelial y marcadores específicos: hacia conceptos y metodologías emergentes. Entidad Financiadora: MINECO. Investigador Principal: Rodrigo Barderas y Mayte Villalba. Duración: 2015-2017. Cuantía: 140.000 € + costes indirectos. SAF2014-53209-R.
  • PROYECTO: Plataforma en Red de Recursos Biomoleculares y Bioinformáticos (Proteored ISCIII). Entidad Financiadora: ISCIII. Investigador Asociado al Nodo del CIB: Investigador Principal: Ignacio Casal. 2014-2017
  • PROYECTO: ASMA, REACCIONES ADVERSAS Y ALÉRGICAS. Redes Temáticas de Investigación Cooperativa en Salud (ARADyAL). Entidad Financiadora: Ministerio de Economía y competitividad. ISCIII RD16/0006/0014. Investigador Principal: María José Torres. Duración: 2017-2020. Investigador en Grupo UCM.
     
Barra de búsqueda
Personalizado

Publicaciones destacadas

Categoría
Ordenar

Survival Patterns of Human Prion Diseases in Spain, 1998-2018: Clinical Phenotypes and Etiological Clues

Tejedor-Romero L, López-Cuadrado T, Almazán-Isla J, Calero M, García López FJ, de Pedro-Cuesta J. Survival Patterns of Human Prion Diseases in Spain, 1998-2018: Clinical Phenotypes and Etiological Clues. Front Neurosci. 2022 15:773727. doi: 10.3389/fnins.2021.773727. eCollection 2021.

DOI

ATXN1 repeat expansions confer risk for amyotrophic lateral sclerosis and contribute to TDP-43 mislocalization

Tazelaar GHP, Boeynaems S, De Decker M, van Vugt J, Kool L, Goedee HS, et al. ATXN1 repeat expansions confer risk for amyotrophic lateral sclerosis and contribute to TDP-43 mislocalization. Brain Commun. 2020,2(2):fcaa064. Q1

Magnetic microbeads-based amperometric immunoplatform for the rapid and sensitive detection of N6-methyladenosine to assist in metastatic cancer cells discrimination

Eloy Povedano, María Gamella, Rebeca M. Torrente-Rodríguez, Ana Montero-Calle, María Pedrero, Guillermo Solís-Fernández, Fernando Navarro-Villoslada, Rodrigo Barderas, Susana Campuzano, José M. Pingarrón. Magnetic microbeads-based amperometric immunoplatform for the rapid and sensitive detection of N6-methyladenosine to assist in metastatic cancer cells discrimination. Biosensors and Bioelectronics. 2021; 171:112708

DOI

SOS GEFs in health and disease

Baltanás FC, Zarich N, Rojas- Cabañeros JM & Santos E. SOS GEFs in health and disease. BBA-Reviews on Cancer. 2020; 188445. doi: 10.1016/j.bbcan.2020.188445

DOI

Thyroid hormone increases bulk histones expression by enhancing translational efficiency

Thyroid hormone increases bulk histones expression by enhancing translational efficiency. Zambrano A, García-Carpizo V, Villamuera R, Aranda A. Mol Endocrinol. 2015 Jan;29(1):68-75. doi: 10.1210/me.2014-1235. PMID: 25422881; PMCID: PMC5414774.

PUBMED DOI

Epidemiological bases and molecular mechanisms linking obesity, diabetes, and cancer

Gutiérrez-Salmerón M, Chocarro-Calvo A, García-Martínez JM, de la Vieja A, García-Jiménez C. Epidemiological bases and molecular mechanisms linking obesity, diabetes, and cancer. Endocrinol Diabetes Nutr. 2017 Feb; 64(2):109-117. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28440775) doi:10.1016/j.endinu.2016.10.005

PUBMED DOI

Salivary lactoferrin as biomarker for Alzheimer's disease: Brain-immunity interactions

Bermejo-Pareja F, Del Ser T, Valentí M, de la Fuente M, Bartolome F, Carro E. Salivary lactoferrin as biomarker for Alzheimer's disease: Brain-immunity interactions. Alzheimers Dement. 2020 Aug;16(8):1196-1204. doi: 10.1002/alz.12107.

DOI

Ocoxin Modulates Cancer Stem Cells and M2 Macrophage Polarization in Glioblastoma

Hernández SanMiguel, E.; Gargini, R.; Cejalvo, T., Segura-Collar B, Núñez-Hervada P, Hortigüela R, Sepúlveda-Sánchez JM, Hernández-Laín A, Pérez-Núñez A, Sanz E, Sánchez Gómez, P. (2019) Ocoxin Modulates Cancer Stem Cells and M2 Macrophage Polarization in Glioblastoma. Oxid.Med.Cell. Longev. pp.9719730. PMID: 31467641. doi: 10.1155/2019/9719730

DOI

Impact of environmental neurotoxic: current methods and usefulness of human stem cells

Rosca, A.; Coronel, R.; Moreno, M.; González, R.; Oniga, A.; Martín, A.; López, V.; González, M.C.; Liste, I. (2020). Impact of environmental neurotoxic: current methods and usefulness of human stem cells. Heliyon. 6, e05773. doi: 10.1016/j.heliyon.2020.e05773.

DOI

Genomic Characterization of Host Factors Related to SARS-CoV-2 Infection in People with Dementia and Control Populations: The GR@ACE/DEGESCO Study

de Rojas I, Hernández I, Montrreal L, Quintela I, Calero M, Royo JL, Huerto Vilas R, González-Pérez A, Franco-Macías E, Macías J, Menéndez-González M, Frank-García A, Diez-Fairen M, Lage C, García-Madrona S, Aguilera N, García-González P, Puerta R, Sotolongo-Grau O, Alonso-Lana S, Rábano A, Arias Pastor A, Pastor AB, Corma-Gómez A, Martín Montes A, Martínez Rodríguez C, Buiza-Rueda D, Periñán MT, Rodriguez-Rodriguez E, Alvarez I, Rosas Allende I, Pineda JA, Bernal Sánchez-Arjona M, Fernández-Fuertes M, Mendoza S, Del Ser T, Gr Ace/Degesco Consortium, Garcia-Ribas G, Sánchez-Juan P, Pastor P, Bullido MJ, Álvarez V, Real LM, Mir P, Piñol-Ripoll G, García-Alberca JM, Medina M, Orellana A, Butler CR, Marquié M, Sáez ME, Carracedo Á, Tárraga L, Boada M, Ruiz A. Genomic Characterization of Host Factors Related to SARS-CoV-2 Infection in People with Dementia and Control Populations: The GR@ACE/DEGESCO Study. J Pers Med. 2021 11(12):1318. doi: 10.3390/jpm11121318.

DOI

Impact of environmental neurotoxic: current methods and usefulness of human stem cells

Rosca A, Coronel R, Moreno M, Gonzalez R, Oniga A, Martin A, et al. Impact of environmental neurotoxic: current methods and usefulness of human stem cells. Heliyon. 2020,6(12):e05773. Q1

Bringing to Light the Importance of the miRNA Methylome in Colorectal Cancer Prognosis Through Electrochemical Bioplatforms

Povedano E, Ruiz-Valdepeñas Montiel V, Sebuyoya R, Torrente-Rodríguez RM, Garranzo-Asensio M, Montero-Calle A, Pingarrón JM, Barderas R, Bartosik M, Campuzano S. Bringing to Light the Importance of the miRNA Methylome in Colorectal Cancer Prognosis Through Electrochemical Bioplatforms. Analytical Chemistry 2024;96:4580

DOI

Minilungs from Human Embryonic Stem Cells to Study the Interaction of Streptococcus pneumoniae with the Respiratory Tract

Sempere J, Rossi SA, Chamorro-Herrero I, González-Camacho F, de Lucas MP, Rojas-Cabañeros JM, Taborda CP, Zaragoza O, Yuste J & Zambrano A. Minilungs from Human Embryonic Stem Cells to Study the Interaction of Streptococcus pneumoniae with the Respiratory Tract. Microbiology Spectrum. 2022; 10(3):e00453-22. doi: 10.1128/spectrum.00453-22

DOI

The thyroid hormone receptor β induces DNA damage and premature senescence

The thyroid hormone receptor β induces DNA damage and premature senescence. Zambrano A, García-Carpizo V, Gallardo ME, Villamuera R, Gómez-Ferrería MA, Pascual A, Buisine N, Sachs LM, Garesse R, Aranda A. J Cell Biol. 2014 Jan 6;204(1):129-46. doi: 10.1083/jcb.201305084. PMID: 24395638; PMCID: PMC3882795.

PUBMED DOI

From obesity to diabetes and cancer: epidemiological links and role of therapies

García-Jiménez C, Gutiérrez-Salmerón M, Chocarro-Calvo A, García-Martínez JM, Castaño A, De la Vieja A. From obesity to diabetes and cancer: epidemiological links and role of therapies. Br J Cancer. 2016 Mar 29; 114(7):716-22. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26908326) doi: 10.1038/bjc.2016.37

PUBMED DOI

Aquaporin 5 in Alzheimer's disease: a link between oral and brain pathology?

Municio C, Carro E. Aquaporin 5 in Alzheimer's disease: a link between oral and brain pathology? Neural Regen Res. 2023 Jul;18(7):1491-1492. doi: 10.4103/1673-5374.361545.

DOI

The Netrin-4/ Neogenin-1 axis promotes neuroblastoma cell survival and migration

Villanueva AA, Falcón P, Espinoza N, R LS, Milla LA, Hernández-SanMiguel E, Torres VA, Sanchez-Gomez P, Palma V. (2017) The Netrin-4/ Neogenin-1 axis promotes neuroblastoma cell survival and migration. Oncotarget 8(6):9767-9782. PMID: 28038459 doi: 18632/oncotarget.14213

DOI

Analysis of Benzalkonium Chloride Resistance and Potential Virulence of Listeria monocytogenes Isolates Obtained from Different Stages of a Poultry Production Chain in Spain

Lopez-Alonso V, Ortiz S, Corujo A, Martinez-Suarez JV. Analysis of Benzalkonium Chloride Resistance and Potential Virulence of Listeria monocytogenes Isolates Obtained from Different Stages of a Poultry Production Chain in Spain. J Food Prot. 2020,83(3):443-51. Q2

Physiological and pathological effects of amyloid-β species in neural stem cell biology

Bernabeu-Zornoza, A.; Coronel, R.; Palmer, C.; Monteagudo, M.; Zambrano, A.; Liste, I. (2019). Physiological and pathological effects of amyloid-β species in neural stem cell biology. Neural Regen Res. 14, 2035-2042. doi: 10.4103/1673-5374.262571.

DOI

Selenium Increases Thyroid-Stimulating Hormone-Induced Sodium/Iodide Symporter Expression Through Thioredoxin/Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease 1-Dependent Regulation of Paired Box 8 Binding Activity. Antioxid Redox Signal. 2016 May 20; 24(15):855-66. (*co-corresponding authors) (IF: 6,337)

Leoni SG, Sastre-Perona A, De la Vieja A, Santisteban P. Selenium Increases Thyroid-Stimulating Hormone-Induced Sodium/Iodide Symporter Expression Through Thioredoxin/Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease 1-Dependent Regulation of Paired Box 8 Binding Activity. Antioxid Redox Signal. 2016 May 20; 24(15):855-66. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26908326) doi: 10.1089/ars.2014.6228

PUBMED DOI

Unraveling autoimmune and neurodegenerative diseases by amperometric serological detection of antibodies against aquaporin-4

Arévalo B, Blázquez M, Serafín V, Montero-Calle A, Calero M, Valverde A, Barderas R, Campuzano S, Yáñez-Sedeño P, Pingarrón JM. Unraveling autoimmune and neurodegenerative diseases by amperometric serological detection of antibodies against aquaporin-4. Bioelectrochemistry. 2021 144:108041. doi: 10.1016/j.bioelechem.2021.108041.

DOI

Spatial Proteomic Analysis of Isogenic Metastatic Colorectal Cancer Cells Reveals Key Dysregulated Proteins Associated with Lymph Node, Liver, and Lung Metastasis

Solís-Fernández G, Montero-Calle A, Martínez-Useros J, López-Janeiro Á, de los Ríos V, Sanz R, Dziakova J, Milagrosa E, Fernández-Aceñero MJ, Peláez-García A, et al. Spatial Proteomic Analysis of Isogenic Metastatic Colorectal Cancer Cells Reveals Key Dysregulated Proteins Associated with Lymph Node, Liver, and Lung Metastasis. Cells. 2022; 11(3):447

DOI

PKD phosphorylation and COP9/Signalosome modulate intracellular Spry2 protein stability

Martínez N, Gragera T, de Lucas MP, Cámara AB, Ballester A, Anta B, Fernández-Medarde A, López-Briones T, Ortega J, Peña-Jiménez D, Barbáchano A, Montero-Calle A, Cordero V, Barderas R, Iglesias T, Yunta M, Oliva JL, Muñoz A, Santos E, Zarich N & Rojas-Cabañeros JM. PKD phosphorylation and COP9/Signalosome modulate intracellular Spry2 protein stability. Oncogenesis. 2023; 12:20. doi.org/10.1038/s41389-023-00465-3

DOI

Decreased salivary lactoferrin levels are specific to Alzheimer's disease

González-Sánchez M, Bartolome F, Antequera D, Puertas-Martín V, González P, Gómez-Grande A, Llamas-Velasco S, Herrero-San Martín A, Pérez-Martínez D, Villarejo-Galende A, Atienza M, Palomar-Bonet M, Cantero JL, Perry G, Orive G, Ibañez B, Bueno H, Fuster V, Carro E. Decreased salivary lactoferrin levels are specific to Alzheimer's disease. EBioMedicine. 2020 Jul;57:102834. doi: 10.1016/j.ebiom.2020.102834.

DOI

Applied mathematics and nonlinear sciences in the war on cancer

Pérez-García VM, Fitzpatrick S, Pérez-Romasanta LA, Pesic M, Schucht P, Arana E, Sánchez-Gómez P. (2016) Applied mathematics and nonlinear sciences in the war on cancer. App. Math. Nonlin. Sci. 1(2): 423–436 doi: 10.21042/AMNS.2016.2.00036

DOI

Physiological effects of amyloid precursor protein and its derivatives on neural stem cell biology and signaling pathways involved

Coronel, R.; Palmer, C.; Bernabeu-Zornoza, A.; Monteagudo, M.; Rosca, A.; Zambrano, A.; Liste, I. (2019). Physiological effects of amyloid precursor protein and its derivatives on neural stem cell biology and signaling pathways involved. Neural Regen Res. 14, 1661-1671. doi: 10.4103/1673-5374.257511.

DOI

Insulin drives glucose-dependent insulinotropic peptide expression via glucose-dependent regulation of FoxO1 and LEF1/β-catenin

García-Martínez JM, Chocarro-Calvo A, De la Vieja A, García-Jiménez C. Insulin drives glucose-dependent insulinotropic peptide expression via glucose-dependent regulation of FoxO1 and LEF1/β-catenin. Biochim Biophys Acta. 2014 Nov; 1839(11):1141-50. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25091498) doi:10.1016/j.bbagrm.2014.07.020

PUBMED DOI

Impaired glucose metabolism reduces the neuroprotective action of adipocytokines in cognitively normal older adults with insulin resistance

Lopez-Vilaret KM, Cantero JL, Fernandez-Alvarez M, Calero M, Calero O, Lindín M, Zurrón M, Díaz F, Atienza M. Impaired glucose metabolism reduces the neuroprotective action of adipocytokines in cognitively normal older adults with insulin resistance. Aging (Albany NY). 2021 13(21):23936-23952. doi: 10.18632/aging.203668.

DOI

The project MinE databrowser: bringing large-scale whole-genome sequencing in ALS to researchers and the public

van der Spek RAA, van Rheenen W, Pulit SL, Kenna KP, van den Berg LH, Veldink JH, et al. The project MinE databrowser: bringing large-scale whole-genome sequencing in ALS to researchers and the public. Amyotroph Lateral Scler Frontotemporal Degener. 2019,20(5-6):432-40. Q1

Brain and immune system-derived extracellular vesicles mediate regulation of complement system, extracellular matrix remodeling, brain repair and antigen tolerance in Multiple sclerosis

Torres Iglesias G, Fernández-Fournier M, Botella L, Piniella D, Laso-García F, Gómez-de Frutos MC, Chamorro B, Puertas I, Tallón Barranco A, Fuentes B, de Leciñana MA, Alonso-López E, Bravo SB, Miranda-Carús ME, Montero-Calle A, Barderas R, Díez-Tejedor E, Gutiérrez-Fernández M, Otero-Ortega L. Brain and immune system-derived extracellular vesicles mediate regulation of complement system, extracellular matrix remodeling, brain repair and antigen tolerance in Multiple sclerosis. Brain, Behavior, and Immunity. 2023; 113:44

DOI

Salivary lactoferrin is associated with cortical amyloid-beta load, cortical integrity, and memory in aging

Reseco L, Atienza M, Fernandez-Alvarez M, Carro E, Cantero JL. Salivary lactoferrin is associated with cortical amyloid-beta load, cortical integrity, and memory in aging. Alzheimers Res Ther. 2021 Sep 6;13(1):150. doi: 10.1186/s13195-021-00891-8.

DOI

Preclinical test of dacomitinib, an irreversible EGFR inhibitor, confirms its effectiveness for glioblastoma

Zahonero C, Aguilera P, Ramírez-Castillejo C, Pajares M, Bolós MV, Cantero C, Pérez-Núñez A, Hernández-Laín A, Sánchez-Gómez P*, Sepúlveda JM*. (*Co-corresponding authors) (2015) Preclinical test of dacomitinib, an irreversible EGFR inhibitor, confirms its effectiveness for glioblastoma. Mol. Can. Ther. 14(7):1548-58. PMID: 25939761 doi: 10.1158/1535-7163.MCT-14-0736

DOI

Whole-Genome Sequences of Seven Listeria monocytogenes Strains from Different Stages of a Poultry Meat Production Chain

Lopez-Alonso V, Ortiz S, Martinez-Suarez JV. Whole-Genome Sequences of Seven Listeria monocytogenes Strains from Different Stages of a Poultry Meat Production Chain. Microbiol Resour Announc. 2019,8(11). Q4

Role of amyloid precursor protein (APP) and its derivatives in the biology and cell fate specification of neural stem cells

Coronel, R.; Bernabeu-Zornoza, A.; Palmer, C.; Muñiz-Moreno, M.; Zambrano, A.; Cano, E.; Liste, I. (2018). Role of amyloid precursor protein (APP) and its derivatives in the biology and cell fate specification of neural stem cells. Mol Neurobiol. 55, 7107-7117. doi: 10.1007/s12035-018-0914-2.

DOI

Medial Temporal Lobe Involvement in Human Prion Diseases: Implications for the Study of Focal Non Prion Neurodegenerative Pathology

Rábano A, Guerrero Márquez C, Juste RA, Geijo MV, Calero M. Medial Temporal Lobe Involvement in Human Prion Diseases: Implications for the Study of Focal Non Prion Neurodegenerative Pathology. Biomolecules. 2021 Mar 10;11(3):413. doi: 10.3390/biom11030413.

DOI

Flat clathrin lattices are linked to metastatic potential in colorectal cancer

Cresens C, Solís-Fernández G, Tiwari A, Nuyts R, Hofkens J, Barderas R, Rocha S. Flat clathrin lattices are linked to metastatic potential in colorectal cancer. iScience. 2023; 26: 107327

DOI

NIS mediates iodide uptake in the female reproductive tract and is a poor prognostic factor in ovarian cancer

Riesco-Eizaguirre G, Leoni SG, Mendiola M, Estévez-Cebrero MA, Gallego MI, Redondo A, Hardisson D, Santisteban P, De la Vieja A. NIS mediates iodide uptake in the female reproductive tract and is a poor prognostic factor in ovarian cancer. J Clin Endocrinol Metab. 2014 Jul; 99(7):E1199-208. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24708099) doi: 10.1210/jc.2013-4249

PUBMED DOI

Standardizing salivary lactoferrin measurements to obtain a robust diagnostic biomarker for Alzheimer's disease

Bartolome F, Orive G, Carro E. Standardizing salivary lactoferrin measurements to obtain a robust diagnostic biomarker for Alzheimer's disease. Alzheimers Dement (Amst). 2021 May 2;13(1):e12173. doi: 10.1002/dad2.12173.

DOI

Controlled release microspheres loaded with BMP7 suppress primary tumors from human glioblastoma

González-Gómez P, Crecente-Campo J, Zahonero C, de la Fuente M, Hernández-Laín A, Mira H*, Sánchez-Gómez P*, García-Fuentes M* (* Co-corresponding authors). (2015) Controlled release microspheres loaded with BMP7 suppress primary tumors from human glioblastoma. Oncotarget, 6 (13): 10950-10963. PMID: 25860932 doi: 10.18632/oncotarget.3459

DOI

Advances in Alzheimer’s disease research: Human cerebral organoids

Mateos-Martínez, P.; González-Sastre, R.; Coronel, R.; Rosca, A.; Martín-Benito, S.; Bernabeu-Zornoza, A.; López-Alonso, V.; Liste, I. (2023). Advances in Alzheimer’s disease research: Human cerebral organoids. Am J Biomed Sci & Res. 18, AJBSR.MS.ID.002421. doi: 10.34297/AJBSR.2023.18.002421.

DOI

Validation of a novel and accurate ApoE4 assay for automated chemistry analyzers

Veiga S, Rodríguez-Martín A, Garcia-Ribas G, Arribas I, Menacho-Román M, Calero M. Validation of a novel and accurate ApoE4 assay for automated chemistry analyzers. Sci Rep. 2020 10(1):2138. doi: 10.1038/s41598-020-58841-7.

DOI

Advances in Alzheimer’s Disease Research: Human Cerebral Organoids

Mateos P., González R., Coronel R., Rosca A, Martín S., Bernabeu A, López-Alonso V and Liste I. Advances in Alzheimer’s Disease Research: Human Cerebral Organoids. American Journal of Biomedical Science & Research. 2023; 715:719.

Multiomics Profiling of Alzheimer’s Disease Serum for the Identification of Autoantibody Biomarkers

San Segundo-Acosta P, Montero-Calle A, Jernbom-Falk A, Alonso-Navarro M, Pin E, Andersson E, Hellström C, Sánchez-Martínez M, Rábano A, Solís-Fernández G, Peláez-García A, Martínez-Useros J, Fernández-Aceñero MJ, Månberg A, Nilsson P, Barderas R. Multiomics Profiling of Alzheimer’s Disease Serum for the Identification of Autoantibody Biomarkers. Journal of Proteome Research 2021 20 (11), 5115-5130.

DOI

Kynurenic Acid Levels are Increased in the CSF of Alzheimer's Disease Patients

González-Sánchez M, Jiménez J, Narváez A, Antequera D, Llamas-Velasco S, Martín AH, Arjona JAM, Munain AL, Bisa AL, Marco MP, Rodríguez-Núñez M, Pérez-Martínez DA, Villarejo-Galende A, Bartolome F, Domínguez E, Carro E. Kynurenic Acid Levels are Increased in the CSF of Alzheimer's Disease Patients. Biomolecules. 2020 Apr 8;10(4):571. doi: 10.3390/biom10040571.

DOI

EGFR-dependent mechanisms in glioblastoma: towards a better therapeutic strategy

Zahonero C and Sánchez-Gómez P. (2014) EGFR-dependent mechanisms in glioblastoma: towards a better therapeutic strategy. Cel. Mol. Life Sci. 71 (18): 3465-88. PMID: 24671641 doi: 10.1007/s00018-014-1608-1

DOI

Working Group on Disorders Related to Iodine Deficiency and Thyroid Dysfunction of the Spanish Society of Endocrinology and Nutrition. Iodine supplementation during pregnancy and lactation. Position statement of the working group on disorders related to iodine deficiency and thyroid dysfunction of the Spanish Society of Endocrinology and Nutrition

Donnay S, Arena J, Lucas A, Velasco I, Ares S; Working Group on Disorders Related to Iodine Deficiency and Thyroid Dysfunction of the Spanish Society of Endocrinology and Nutrition.. Iodine supplementation during pregnancy and lactation. Position statement of the working group on disorders related to iodine deficiency and thyroid dysfunction of the Spanish Society of Endocrinology and Nutrition. Endocrinol Nutr. 2014 Jan; 61(1):27-34. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24035326) doi:10.1016/j.endonu.2013.05.004

PUBMED DOI

Treatment of Parkinson’s disease using human stem cells

Palmer, C.; Coronel, R.; Liste, I. (2016). Treatment of Parkinson’s disease using human stem cells. J Stem Cell Res Med. 1, 71-77. doi: 10.15761/JSCRM.1000113.

DOI

Spanish CJD Surveillance Group. Human prion disease surveillance in Spain, 1993-2018: an overview

De Pedro-Cuesta J, Almazán-Isla J, Tejedor-Romero L, Ruiz-Tovar M, Avellanal F, Rábano A, Calero M, García López FJ; Spanish CJD Surveillance Group. Human prion disease surveillance in Spain, 1993-2018: an overview. Prion. 2021. 15(1):94-106. doi: 10.1080/19336896.2021.1933873.

DOI

Human neural stem cells in developmental neurotoxicology: Current scenario and future prospects. Alternative Methods in Neurotoxicology

Rosca A., Coronel R., López-Alonso V, Liste I, González-Caballero M. Carmen. Human neural stem cells in developmental neurotoxicology: Current scenario and future prospects. Alternative Methods in Neurotoxicology. Advances in Neurotoxicology. 2023; 197:226.

In-depth quantitative proteomics analysis revealed C1GALT1 depletion in ECC-1 cells mimics an aggressive endometrial cancer phenotype observed in cancer patients with low C1GALT1 expression

Montero-Calle A, López-Janeiro Á, Mendes ML, Perez-Hernandez D, Echevarría I, Ruz-Caracuel I, Heredia-Soto V, Mendiola M, Hardisson D, Argüeso P, Peláez-García A, Guzman-Aranguez A, Barderas R. In-depth quantitative proteomics analysis revealed C1GALT1 depletion in ECC-1 cells mimics an aggressive endometrial cancer phenotype observed in cancer patients with low C1GALT1 expression. Cell Oncol. 46, 697–715 (2023).

DOI

Annexin A5 prevents amyloid-β-induced toxicity in choroid plexus: implication for Alzheimer's disease

Bartolome F, Krzyzanowska A, de la Cueva M, Pascual C, Antequera D, Spuch C, Villarejo-Galende A, Rabano A, Fortea J, Alcolea D, Lleo A, Ferrer I, Hardy J, Abramov AY, Carro E. Annexin A5 prevents amyloid-β-induced toxicity in choroid plexus: implication for Alzheimer's disease. Sci Rep. 2020 Jun 10;10(1):9391. doi: 10.1038/s41598-020-66177-5.

DOI

A new link between diabetes and cancer: enhanced Wnt/beta-catening signaling by high glucose

García-Jiménez C, Garcia-Martinez JM, Chocarro-Calvo A, and De la Vieja A. A new link between diabetes and cancer: enhanced Wnt/beta-catening signaling by high glucose. Journal of Molecular Endocrinology 2014 52(1): R51-R66. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24049067) doi: 10.1530/JME-13-0152

PUBMED DOI

DYRK1A destabilizes EGFR and reduces EGFR-dependent glioblastoma growth

Pozo Zahonero, Fernández P, Liñares JM, Ayuso A, Hagiwara M, Pérez A, Ricoy JR, Hernández-Laín A, Sepúlveda JM, Sánchez-Gómez P. (2013) Inhibition of DYRK1A destabilizes EGFR and reduces EGFR-dependent glioblastoma growth. J. Clin. Invest. 123(6):2475-87. PMID: 23635774 doi: 10.1172/JCI63623

DOI

Genetic Diversity, Antimicrobial Resistance and Survival upon Manure Storage of Campylobacter jejuni Isolated from Dairy Cattle Farms in the Cantabric Coast of Spain

Varsaki, A.; Ortiz, S.; Santorum, P.; López, P.; López-Alonso, V.; Martínez-Suárez, J.V. Genetic Diversity, Antimicrobial Resistance and Survival upon Manure Storage of Campylobacter jejuni Isolated from Dairy Cattle Farms in the Cantabric Coast of Spain. Zoonotic Dis. 2022, 2, 82–94

Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative. Long runs of homozygosity are associated with Alzheimer's disease

Moreno-Grau S, Fernández MV, de Rojas I, Garcia-González P, Hernández I, Farias F, Budde JP, Quintela I, Madrid L, González-Pérez A, Montrreal L, Alarcón-Martín E, Alegret M, Maroñas O, Pineda JA, Macías J; GR@ACE study group; DEGESCO consortium, Marquié M, Valero S, Benaque A, Clarimón J, Bullido MJ, García-Ribas G, Pástor P, Sánchez-Juan P, Álvarez V, Piñol-Ripoll G, García-Alberca JM, Royo JL, Franco-Macías E, Mir P, Calero M, Medina M, Rábano A, Ávila J, Antúnez C, Real LM, Orellana A, Carracedo Á, Sáez ME, Tárraga L, Boada M, Cruchaga C, Ruiz A; Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative. Long runs of homozygosity are associated with Alzheimer's disease. Transl Psychiatry. 2021 11(1):142. doi: 10.1038/s41398-020-01145-1.

DOI

Endothelial-specific deficiency of megalin in the brain protects mice against high-fat diet challenge

Bartolome F, Antequera D, de la Cueva M, Rubio-Fernandez M, Castro N, Pascual C, Camins A, Carro E. Endothelial-specific deficiency of megalin in the brain protects mice against high-fat diet challenge. J Neuroinflammation. 2020 Jan 14;17(1):22. doi: 10.1186/s12974-020-1702-2.

DOI

Pursuing precision in medicine and nutrition: the rise of electrochemical biosensing at the molecular level

Campuzano S, Barderas R, Moreno-Casbas MT, Almeida A. Pursuing precision in medicine and nutrition: the rise of electrochemical biosensing at the molecular level. Anal Bioanal Chem 416, 2151–2172 (2024)

DOI

Glucose-Induced b-Catenin Acetylation Enhances Wnt Signaling in Cancer

Chocarro-Calvo A, Garcia-Martinez JM, Ardila-González S, De la Vieja A and García-Jiménez C*. Glucose-Induced b-Catenin Acetylation Enhances Wnt Signaling in Cancer. Molecular Cell 2013 49(3):474-486. PMID: 23273980. doi: 10.1016/j.molcel.2012.11.022

DOI

Experimental Radiation System for Effects Assessment in Biological in Vitro and in Vivo Models

V. Ramos, P. Marina, M. Torres-Ruiz, O. J. Suárez, V. López, I. Liste, M. de Alba. "Experimental Radiation System for Effects Assessment in Biological in Vitro and in Vivo Models," 2021 Photonics & Electromagnetics Research Symposium (PIERS), 2021, pp. 2800-2807, doi: 10.1109/PIERS53385.2021.9695112

DOI

TREM2 expression in the brain and biological fluids in prion diseases

Diaz-Lucena D, Kruse N, Thüne K, Schmitz M, Villar-Piqué A, da Cunha JEG, Hermann P, López-Pérez Ó, Andrés-Benito P, Ladogana A, Calero M, Vidal E, Riggert J, Pineau H, Sim V, Zetterberg H, Blennow K, Del Río JA, Marín-Moreno A, Espinosa JC, Torres JM, Sánchez-Valle R, Mollenhauer B, Ferrer I, Zerr I, Llorens F. TREM2 expression in the brain and biological fluids in prion diseases. Acta Neuropathol. 2021 141(6):841-859. doi: 10.1007/s00401-021-02296-1.

DOI

Contenidos con Investigacion Proteómica Funcional .

Listado de personal

Información adicional

El objetivo principal de la Unidad de PROTEÓMICA FUNCIONAL consiste en la identificación de biomarcadores de las enfermedades crónicas más prevalentes utilizando herramientas proteómicas de última generación. Para ello utilizamos técnicas basadas en espectrometría de masas y microarrays de anticuerpos para identificar proteínas alteradas durante la formación y progresión de dichas enfermedades, así como microarrays de proteínas y fagos para analizar la respuesta humoral que tiene lugar en dichos pacientes e identificar autoanticuerpos como biomarcadores específicos de dichas enfermedades. Asimismo, buscamos desarrollar e implementar nuevos métodos que permitan el diagnóstico temprano de dichas patologías.  Nuestro foco de estudio es el cáncer de colon y enfermedades crónicas relacionadas negativamente. Una vez identificadas las moléculas alteradas buscamos entender mediante ensayos funcionales cómo dichas alteraciones afectan a nivel molecular durante la formación y progresión de dichas patologías con el fin de identificar nuevas dianas terapéuticas que permitan actuar contra ellas.  Las principales contribuciones científicas del Grupo de investigación están enmarcadas en el campo de la Proteómica, Cáncer e Inmunología, contribuyendo en los últimos años a la identificación de proteínas y autoanticuerpos específicos de cáncer colorrectal, y al desarrollo de inmunoensayos que permitan un diagnóstico temprano de la patología.


 

 

Noticias/Actualidad/divulgación
Se puede seguir la actualidad y noticias vinculadas a la Unidad de Proteómica Funcional en la cuenta de X

(Barderas' Lab (@ProteoFun) / X, antiguo Twitter)

 
Premios

Distintos miembros del grupo como investigadores predoctorales, postdoctorales o como IP o en colaboración con el grupo de Electroanalisis y Biosensores Electroquímicos liderado por la Dra. Susana Campuzano Ruiz de la Universidad Complutense de Madrid (@GEBE en X) han obtenido 20 premios a comunicaciones tipo póster o comunicaciones orales.
Entre ellos se quiere destacar:

  1. Premios tipo póster: Premios a la comunicación tipo póster de la EAACI 2015, de la Human Proteome Organization 2014, de la SEPROT 2019, 2022, entre otros.
  2. Entre los premios a comunicaciones orales destacar el Premio IMMUNOTEK a la mejor exposición oral de las jornadas de la Sociedad de Inmunología de la Comunidad de Madrid 2015 (Pablo San Segundo Acosta), Joint Congress de las Sociedades Española, Francesa y Portuguesa de Proteómica 2022 en Vilamoura (2022).
  3. “III Premio de Investigación en Medicina Personalizada de Precisión” de la Fundación Roche y la UCM en Febrero de 2022. Rodrigo Barderas, Susana Campuzano y José Manuel Pingarrón.

Patentes

  • Nuevo método para el diagnósitco de glaucoma o cataratas en un sujeto.

Autores: Ana Montero Calle, Raquel Rejas González, Ana Guzmán Aránguez, Alejandro Valverde, Susana Campuzano y Rodrigo Barderas.

Número de solicitud: P202430051. Fecha de recepción: 22 enero 2024.  

  • Método de Diagnóstico/Pronóstico del cáncer colorrectal basado en la detección en suero de anticuerpos frente a autoantígenos tumorales. 

Autores: Ingrid Babel, José Ignacio Casal Álvarez, Rodrigo Barderas.

Número de solicitud: P201030708. Fecha: 13 de mayo de 2010.

Licenciada a Protein Alternatives, S.L. 

  • Método de obtención de datos útiles para el diagnóstico o el pronóstico del cáncer colorrectal. 

Autores: Ingrid Babel, José Ignacio Casal Álvarez, Rodrigo Barderas.

Número de solicitud: P200930203. Fecha: 29 de mayo de 2009.

Licenciada a Protein Alternatives, S.L. 

Contenidos con Investigacion Proteómica Funcional .